Subdiretor-Geral - Não preenchido
Estrutura nuclear
DCAF - Departamento para a Cooperação e Assuntos Financeiros: Andra Nikolic, em acumulação
DRF - Departamento de Recuperação Financeira: Andra Nikolic
DECEA - Departamento de Estudos, Comunicação e Entidades Autárquicas: Dulce Dias
DISII - Departamento de Informática, Sistemas de Informação e Instalações: Joaquim Muxagata
Unidades orgânicas flexíveis
DF - Divisão Financeira: Isabel Faustino
DAJ - Divisão de Apoio Jurídico: Ana Raquel Natário
DAESAL - Divisão de Apoio às Entidades do Subsetor da Administração Local: Ana Paula Bento
DFL - Divisão de Finanças Locais: Joana Lucena
DP - Divisão de Programação: Mário Monteiro
UFE - Unidade de Fundos Estruturais (Equipa Multidisciplinar): Odete Veríssimo
CFA - Centro de Formação Autárquica